مظاهر حسینی، مسئول تشریفات «بیت رهبر»، در تجمع شبانه حکومتی اعلام کرد مجتبی خامنه‌ای در جریان بمباران دفتر علی خامنه‌ای از ناحیه زانو، کمر و پشت گوش آسیب دیده است. حسینی گفت منزل مجتبی خامنه‌ای نیز هدف قرار گرفته که در پی آن همسر او در این حمله کشته شده است. او افزود مجتبی خامنه‌ای هنگام بالا رفتن از پله‌ها بر اثر موج انفجار روی زمین افتاده و دچار آسیب‌دیدگی شده است. به گفته مسئول تشریفات بیت رهبری، محل حضور مجتبی خامنه‌ای که معمولا در آن تدریس می‌کرد نیز «با خاک یکسان» شده و در جریان حملات، شماری از نزدیکان و همراهان دفتر کشته شدند. مظاهر حسینی پیش‌تر نیز در یک فایل صوتی گفته بود  مجتبی خامنه‌ای لحظاتی پیش از اصابت موشک «برای انجام کاری به حیاط رفته» و به همین دلیل تنها «از ناحیه پا اندکی مجروح» شده است.